Evo, DNA'dan öğrenen ve “hayatı yaratan” yapay zeka

Leyla

Global Mod
Global Mod
25 Mar 2021
2,967
0
1
Tıpkı ChatGpt'in çevrimiçi olarak mevcut bilgilerden yararlanarak bir kitabı özetleyebilmesi veya bilgisayar kodu yazabilmesi gibi, bugün Evo adı verilen, DNA'yı okuyan ve tüm genomların işleyişini çıkarsayan bir yapay zeka (AI) var. Sadece bu da değil, elde edilen verileri yeni proteinler tasarlamak ve yeni mikrobiyal genomlar oluşturmak için de kullanabilir. Sayfalarında projeyi anlatan yaratıcıları bu özellikleriyle iddia ediyor. Bilim, Evo, bazı hastalıkları daha iyi anlama, yeni tedaviler geliştirme ve diğer biyomedikal sorulara yanıt verme (aynı zamanda evrimi araştıranlar için de uygulamalar yapma) potansiyeline sahiptir.

Rett sendromunda teşhis yapay zekayla hızlanıyor



kaydeden Simone Valesini

04 Kasım 2024


Evo, Yapay Zekanın temel bir modeli


Tıpkı ChatGpt gibi Evo da yapay zekanın “temel modelidir”. Bunu AlphaFold (yaratıcılarına 2024 Nobel Kimya Ödülü'nü alan, proteinlerin yapısını amino asit dizilerinden tahmin edebilen araç) ile karşılaştırdığımızda, daha az spesifik ama daha çok yönlü bir model olduğunu söyleyebiliriz. Bu, bilim adamlarının zamandan ve paradan tasarruf etmesini sağlar.

Evo, DNA'yı okuyan ilk “temel model” değildir, ancak öncüllerinin sınırlamalarının üstesinden gelmek için geliştirilmiştir: DNA'daki kalıplara yönelik arama penceresi daha geniştir ve genler arasındaki ve diğer genetik materyal dizileri arasındaki bağlantıları tanımlamanıza olanak tanır. . O halde çalışabildiği ayrıntı emsalsizdir: artık nükleotid grupları (DNA'yı oluşturan “tuğlalar”) değil, tek nükleotidler.

Yapay zeka Parkinson hastalığının 3 alt tipini belirledi



kaydeden Simone Valesini

22 Temmuz 2024


Eğitim


Geliştirme aşaması tamamlandığında, araştırmacılar Evo'ya 80 bin mikrop genomu ve milyonlarca bakteriyofaj virüsü (yani bakterileri enfekte eden virüsler) ve plazmit (yarı bağımsız dairesel DNA molekülleri) dizisini beslediler. Dört hafta boyunca temel model bu materyal üzerinde eğitildi ve toplam 300 milyar nükleotidden oluşan genomik diziler hakkında bilgi öğrenildi.

Yazarlar, eğitim için insanlara veya diğer ökaryotik organizmalara (yani hücrelerin sitoplazmadan ayrı bir çekirdeğe sahip olduğu tüm organizmalara) saldıran mikroorganizma dizilerini kullanmadıklarının altını çizmeye isteklidirler. Bu, herhangi birinin Evo'yu biyolojik silahlar tasarlamak için istismar etmesini önlemek içindir.

Tıpta yapay zeka mı? Fazla güvenmeyelim



kaydeden Elisa Manacorda

30 Temmuz 2024


Yapay Zeka teste tabi tutuldu


Peki Evo sonuçta tüm bu bilgilerle ne yapabilir? Araştırmacılar, yapay zekanın genetik bir diziyi okuyabildiğini, olası bir mutasyonu tanımlayabildiğini ve ardından bu anormalliğin ilgili proteinin performansını nasıl etkilediğini doğru bir şekilde tahmin edebildiğini gösterdi. Bu gereklilik, DNA'daki kusurların nasıl hastalıkların gelişimine yol açtığını anlamanın ve ilaç tasarımının temelini oluşturmaktadır.

Hepsi bu değil. Tıpkı ChatGpt gibi Evo da yeni içerik oluşturabilir. Örneğin bilim insanları yapay zekadan Crispr-Cas9 DNA kesme aletinin alternatif versiyonlarını tasarlamasını istedi. Evo, öncelikle bakterilerin doğada savunma olarak kullandığı bu enzimatik sistemlere karşılık gelen 70 binin üzerinde bakteriyel DNA dizisini inceledi ve ardından milyonlarca potansiyel yeni alternatif varyant önerdi.

Bunlardan kağıt üzerinde en umut verici olan 11'i, performanslarını test etmek için laboratuvarda sentezlendi ve birinin, çok farklı olmasına rağmen, bugün piyasada bulunan bir versiyon kadar verimli olduğu görüldü. Bu nedenle Evo, doğada bilinmeyen yeni moleküler araçlar üretebilir ve zaman ve kaynak tasarrufu sağlayarak bakteri türlerinde yeni, daha verimli protein arama sürecini değiştirebilir.

Meme kanserinin yeni bir “kalıtsal formu” keşfedildi



kaydeden Tiziana Moriconi

30 Nisan 2024


Yapay zeka ve “yeni” genomlar


Sonunda Evo, en azından kısmen sıfırdan bir mikrobiyal genom yazmayı başardı: bir bakteri genomu oluşturacak kadar uzun diziler üretti, temel bileşenleri ekledi ama aynı zamanda diğer gerekli olanları da “unuttu”. Ancak yazarlara göre bu bir başarı, yapay zeka teknolojisinin sentetik genomlar elde etmesine yönelik önemli bir adım. “Evo, milyarlarca yıllık evrim boyunca DNA'da yazılı kalıpları çözerek biyolojiyi anlama ve tasarlama yeteneğimizde yeni yollar açıyor” dedi. Patrick Hsuçalışmanın ana yazarları arasında – Üretken yapay zekanın metin, ses ve video ile çalışma şeklimizde devrim yaratması gibi, aynı yaratıcı yetenekler artık yaşamın temel kodlarına da uygulanabilir.” Öncelikle Evo modeli sadece bir başlangıç.

Francesca Buffa, teorik fizikten kanser araştırmalarına. Yapay Zeka ile



kaydeden Tiziana Moriconi

10 Şubat 2024